La FICF centra la seva activitat de recerca en la farmacoepidemiologia i aquesta ha estat una de les seves principals activitats.
La FICF, fundadora del Sistema Espanyol de Farmacovigilància (SEFV) l'any 1983, du a terme l'execució del Programa de Farmacovigilància a Catalunya i és el Centre de Farmacovigilància de Catalunya.
La FICF investiga l'efectivitat de l'ús dels medicaments i els problemes de toxicitat derivats de la seva utilització en la pràctica clínica habitual. Aquesta activitat inclou la farmacovigilància, la coordinació d'estudis sobre malalties específiques, i la realització d'EUM-Estudis d'utilització de medicaments.
A l'àrea d'Assaig Clínic i metanàlisi el Servei de Farmacologia Clínica avalua els
protocols d'assaig clínic presentats al Comitè Ètic d'Investigació Clínica 
de l'Hospital
Universitari Vall d'Hebron (HUVH). En col·laboració amb altres serveis i institucions
es desenvolupen assaigs clínics de promoció independent.
de l'Agència Europea del Medicament (EMEA) i també del projecte PROTECT , un consorci públic-privat europeu, coordinat per l'EMEA, en el qual participen 15 centres públics, 11 companyies farmacèutiques, una associació de pacients i dues PIME. A més, forma part de la Fundació Institut de Recerca Hospital Universitari Vall d'Hebron (FIRHUVH) , en la qual constitueix un grup de recerca transversal.
La FICF, a més, realitza activitats de suport a la recerca, per tal de facilitar i promoure
la recerca clínica en totes les àrees hospitalàries i en l'àmbit corresponent d'atenció
primària a través de la Unitat de suport en Mètodes per a la Investigació Clínica (USMIB)
i del Servei Asesoría a la Investigacón en Atención Primaria (SAIAP) .
També edita el butlletí de Investigación Clínica y Bioética.
La FICF ha coordinat diversos estudis sobre l'ús terapèutic del cànnabis .